查理大学（Charles University）即布拉格大学，简称查大，由神圣罗马帝国皇帝查理四世创建于1348年，坐落于捷克共和国首都布拉格，是捷克共和国最高学府，也是阿尔卑斯山以北、巴黎以东的第一所大学，与博洛尼亚大学（1088年）、巴黎大学（1257年）和牛津大学（1096年）并称欧洲文化中心，是科英布拉集团、国际公立大学论坛、Europaeum、4EU+联盟、欧洲大学协会、欧洲大学基金会及欧洲首都大学联盟成员，位列2021U.S. News世界大学排名第210名。

捷克理工大学（Czech Technical University in Prague），位于捷克首都布拉格，是中欧地区最古老的理工大学，也是代表捷克工程水平最高的大学。捷克理工大学由约瑟夫一世于1707年创建，在尖端科技和工程领域有着悠久的历史。捷克理工大学在众多伟大科学家的传承下拥有着高质量的教学水平.

马萨里克大学（Masaryk University）成立于1919年，位于捷克共和国第二大城市布尔诺，校名为纪念捷克斯洛伐克国父马萨里克，是捷克规模第二大的大学。1960年，更名为扬·埃万杰利斯塔·普尔基涅大学，以纪念捷克生物学家扬·埃万杰利斯塔·普尔基涅。1990年，更名为布尔诺马萨利克大学。2006年，校名去掉了“布尔诺”的字样，即马萨里克大学。

帕拉茨基大学（Palacký University Olomouc）全称奥洛穆茨帕拉茨基大学，位于捷克共和国奥洛穆茨，是一所公立高校，学校成立于1573年。帕拉茨基大学是捷克共和国第二古老的大学和拉维亚地区最古老的大学。大学原名奥洛穆茨大学，1946年改为现名以纪念19世纪摩拉维亚历史学家和政治家法兰西斯柯·帕拉茨基。

捷克生命科学大学（Czech University of Life Sciences, Prague）是捷克共和国的农业教育和研究大学，也是中国教育部认证的公立研究型大学。捷克技术大学于1906年设立了农业研究学，第一批农业工程师于1911年毕业。1920年农业和林业学院成立，1952年，该学院成为独立大学。1966年，它搬到了布拉格 - 索多尔的新校园。

布拉格经济大学（Prague University of Economics and Business），创建于1953年，它是捷克在经济学、商务、信息学领域中最大规模的高等院校。布拉格经济大学是捷克首屈一指的专业性经济大学，拥有四十五年的历史传统，前总理克劳斯以及现任总统泽曼均从布拉格经济大学毕业。

布拉格化工大学（The University of Chemistry and Technology Prague）是捷克化学领域自然研究中心，也是该国最大的教育和研究机构之一，专注于技术化学，化学和生物化学技术，材料和化学工程，食品化学和环境研究。